检验检疫通关一体化是指通过优化检验检疫工作流程，以“三通”（通报、通检、通放）为基础，对进出口货物实施“两直”（出口直放、进口直通），促进对外贸易便利化。
据介绍，检验检疫通关一体化工作从京津冀、丝绸之路经济带、长江经济带、泛珠三角、东北三省及内蒙古自治区区域通关一体化探索开始，完成了信息化系统的升级改造和直属检验检疫局系统部署，全面搭建起全国检验检疫通关一体化的“高速公路”，形成了覆盖所有直属局的通关一体化格局，实现了全国各机构间的互联互通。
自今年9月21日通关一体化系统试运行至今，全国检验检疫部门共办理“两直”一体化业务137189批次，每批出口货物通关放行时间平均节省0．5天以上，节约成本约100元；每批进口货物通关放行时间平均节省1天以上，节约成本约300元。
质检总局有关负责人表示，从区域通关一体化到全国通关一体化已经实现，下一步要加快实现从全国通关一体化到检验检疫业务一体化的目标。要加强负面清单管理，合理确定“两直”范围，打造合理的沿海内陆业务布局，建立完善一体化业务流程和规范，统一监管措施，统一执法尺度，细化监管规则，增强可操作性。
质检总局还要求加强口岸内地协作，充分利用信息化平台，实现数据共享，检测结果互认，确保全国检验检疫通关一体化“高速公路”运行顺畅。
