为进一步加强H7N9禽流感防控，全面强化疫情排查和病毒监测，及时处置突发情况，农业部印发了《动物H7N9禽流感紧急监测方案》和《动物H7N9禽流感应急处置指南(试行)》(下称《监测方案》和《处置指南》)。
根据《监测方案》，监测目的为了掌握了解H7N9禽流感病毒在动物群体中的来源、宿主范围、传播途径和危害程度，为及时清除动物群体中的H7N9禽流感病原提供科学依据。《监测方案》明确，已发生人感染H7N9禽流感病例和经国家禽流感参考实验确诊有动物H7N9禽流感阳性的省份为核心监测区，与核心监测区相邻的省份为重点监测区，上述两类监测区以外的省份为一般监测区。监测对象包括鸡、水禽(鸭、鹅)和人工饲养的鸽子、鹌鹑等；野生禽类；生猪。
《处置指南》规定了动物H7N9禽流感的阳性确认、处置、紧急流行病学调查和人员防护要求：经农业部确认为H7亚型禽流感病毒感染阳性的，对感染群的所有动物进行扑杀，对扑杀动物及其产品进行无害化处理。
