《意见》提出，建立“两区”是实施藏粮于地、藏粮于技战略的重要举措。要以确保国家粮食安全和保障重要农产品有效供给为目标，以深入推进农业供给侧结构性改革为主线，以主体功能区规划和优势农产品布局规划为依托，以永久基本农田为基础，将粮食和重要农产品生产能力细化落实到具体地块，优化区域布局和要素组合，促进农业结构调整，提升农产品质量效益和市场竞争力，为推进农业现代化建设、全面建成小康社会奠定坚实基础。
《意见》强调，要坚持“底线思维、科学划定，统筹兼顾、持续发展，政策引导、农民参与，完善机制、建管并重”的基本原则，力争用3年时间完成约10.58亿亩“两区”地块的划定任务，做到“两区”地块全部建档立卡、上图入库，实现信息化和精准化管理。力争用5年时间基本完成“两区”建设任务，形成布局合理、数量充足、设施完善、产能提升、管护到位、生产现代化的粮食生产功能区和重要农产品生产保护区，成为确保国家粮食安全、稳定重要农产品自给水平的基本支撑。
《意见》明确，要科学确定“两区”划定标准，自上而下将划定任务分解落实到省、市、县，以县为基础精准落地，明确到具体地块，建立电子地图和数据库，汇总形成全国“两区”建设一张图。要大力推进“两区”建设，强化高标准农田等综合生产能力建设，积极发展适度规模经营，着力提高“两区”农业社会化服务水平。要切实强化监管，完善相关制度，严格落实管护责任，建立监测监管体系，加强动态监测和信息共享，强化监督考核，依法保护“两区”。
《意见》要求，要加大对“两区”的政策支持，增加基础设施建设投入，完善财政支持政策，创新金融支持政策。各省（区、市）人民政府对“两区”划定、建设和管护工作负总责，有关部门要加强指导、协调和监督检查，细化制定具体实施办法、管理细则，出台相关配套政策，抓好工作落实。