《意见》指出，农产品加工业已成为农业现代化的支撑力量和国民经济的重要产业。进一步促进农产品加工业发展对促进农业提质增效、农民就业增收和农村一二三产业融合发展，对提高人民群众生活质量和健康水平、保持经济平稳较快增长有着十分重要的作用。
《意见》强调，要坚持“以农为本、转化增值，市场主导、政府支持，科技支撑、综合利用，集聚发展、融合互动”的原则，在确保国家粮食安全和农产品质量安全的基础上，以转变发展方式、调整优化结构为主线，以市场需求为导向，以增加农民收入、提高农业综合效益和竞争力为核心，推动农产品加工业从数量增长向质量提升、要素驱动向创新驱动、分散布局向集群发展转变，促进农产品加工业持续稳定健康发展。
《意见》提出，到2020年，农产品加工转化率达到68%，加工业主营业务收入年均增长6%以上，农产品加工业与农业总产值比达到2.4∶1。到2025年，农产品加工转化率达到75%，农产品加工业与农业总产值比进一步提高，基本接近发达国家农产品加工业发展水平。
《意见》从四个方面部署推进农产品加工业发展。一是优化结构布局。推进农产品加工业向优势产区集中布局，明确大宗农产品主产区、特色农产品优势区、大中城市郊区及都市农业区和贫困地区的发展重点。统筹农产品初加工、精深加工及主食加工等协调发展。
二是推进多种业态发展。支持农民合作社、种养大户、家庭农场发展加工流通。鼓励企业打造全产业链，让农民分享加工流通增值收益。创新模式和业态，利用信息技术培育现代加工新模式。推进加工园区建设，创建产业集群和融合发展先导区，建设农产品加工特色小镇。
三是加快产业转型升级。提升科技创新能力，强化协同创新机制，建设一批农产品加工技术集成基地。加速科技成果转化推广，鼓励建设科技成果转化交易中心，支持科技人员以科技成果入股加工企业。提高企业管理水平，引导企业依标生产，提升质量水平，培育知名品牌。加强人才队伍培养，培育一批经营管理队伍、科技领军人才、创新团队、生产能手和技能人才。
四是完善相关政策措施。加强财政支持，支持符合条件的加工企业申请有关支农资金和项目。完善税收政策，扩大农产品增值税进项税额核定扣除试点行业范围，落实农产品初加工企业所得税优惠政策。强化金融服务，加大信贷支持力度，扩大担保业务规模，创新“信贷+保险”、产业链金融等服务模式。改善投资贸易条件，支持社会资本从事农产品加工、流通。落实用地用电政策，执行农产品初加工用地政策。