东北黑土层厚度不断变薄，目前吉林省黑土腐殖质层厚度在20至30厘米的面积占黑土总面积的25%左右，腐殖质层厚度小于20厘米的占12%左右，完全丧失腐殖质层的占3%左右。
吉林和黑龙江两省的黑土总面积约为1000万公顷，而1982年第二次全国土壤普查统计，吉林和黑龙江两省的黑土总面积仅为592万公顷，比新中国成立初期减少了约400万公顷。
目前黑土区土壤有机质含量明显下降，耕层有机质含量以平均每年0.08%的速度下降，由开垦前的3%至6%（高的达到8%）降低到当前的1.5%至3%（重者不足1%）。
两会建议，把耕作土壤的区域划定为基本农田保护区，根据黑土的退化程度标明保护的等级，因地制宜制定农业措施，经济建设规划尽量避开黑土农田保护区，尽量减少黑土区的城镇化占用。采取耕作、培肥和工程措施相结合的方法，通过增施有机肥、化肥平衡施用、秸秆还田、深松、宽窄行交替休闲、玉米－大豆轮作、免耕、少耕等保护性耕作措施，改善土壤理化性状和结构，增加土壤有机质含量。